Protein–RNA interactions for Protein: Q969S0

SLC35B4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B4Q969S0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35B4Q969S0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35B4Q969S0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms