Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASKIN2Q8WXE0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASKIN2Q8WXE0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms