Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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C15orf40Q8WUR7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C15orf40Q8WUR7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
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