Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ6

GEMIN5, Gem-associated protein 5, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN5Q8TEQ6 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.157e-8■■■■■ 32
GEMIN5Q8TEQ6 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 32
GEMIN5Q8TEQ6 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.037e-8■■■■■ 32
GEMIN5Q8TEQ6 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.037e-8■■■■■ 32
GEMIN5Q8TEQ6 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.247e-8■■■■■ 32
GEMIN5Q8TEQ6 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 310.43□□□□□ -0.747e-8■■■■■ 32
GEMIN5Q8TEQ6 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.817e-8■■■■■ 32
GEMIN5Q8TEQ6 CAPN2-203ENST00000434648 577 ntTSL 520.51■□□□□ 0.874e-10■■■■■ 32
GEMIN5Q8TEQ6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.714e-10■■■■■ 32
GEMIN5Q8TEQ6 CAPN2-202ENST00000433674 3264 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.174e-10■■■■■ 32
GEMIN5Q8TEQ6 SLC25A5-203ENST00000463551 433 ntTSL 29.36□□□□□ -0.914e-10■■■■■ 32
GEMIN5Q8TEQ6 SLC12A7-206ENST00000634447 3142 ntTSL 518.08■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 31.9
GEMIN5Q8TEQ6 LONRF1-207ENST00000530693 508 ntTSL 423.28■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 31.9
GEMIN5Q8TEQ6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 31.9
GEMIN5Q8TEQ6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.912e-6■■■■■ 31.9
GEMIN5Q8TEQ6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.82e-6■■■■■ 31.9
GEMIN5Q8TEQ6 ACAP2-205ENST00000447662 700 ntTSL 527.42■■□□□ 1.986e-13■■■■■ 31.8
GEMIN5Q8TEQ6 ACAP2-214ENST00000490224 578 ntTSL 427.25■■□□□ 1.956e-13■■■■■ 31.8
GEMIN5Q8TEQ6 ACAP2-211ENST00000480906 1802 ntTSL 1 (best)22.64■■□□□ 1.216e-13■■■■■ 31.8
GEMIN5Q8TEQ6 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.136e-13■■■■■ 31.8
GEMIN5Q8TEQ6 ACAP2-215ENST00000618471 3207 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.226e-13■■■■■ 31.8
GEMIN5Q8TEQ6 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 31.6
GEMIN5Q8TEQ6 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 31.6
GEMIN5Q8TEQ6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.912e-7■■■■■ 31.6
GEMIN5Q8TEQ6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.53e-11■■■■■ 31.5
GEMIN5Q8TEQ6 SURF4-201ENST00000371982 553 ntTSL 324.71■■□□□ 1.553e-11■■■■■ 31.5
GEMIN5Q8TEQ6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.163e-11■■■■■ 31.5
GEMIN5Q8TEQ6 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.143e-11■■■■■ 31.5
GEMIN5Q8TEQ6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.963e-11■■■■■ 31.5
GEMIN5Q8TEQ6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.93e-11■■■■■ 31.5
GEMIN5Q8TEQ6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.843e-11■■■■■ 31.5
GEMIN5Q8TEQ6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.093e-6■■■■■ 31.5
GEMIN5Q8TEQ6 PHPT1-205ENST00000492540 1316 ntTSL 1 (best)32.14■■■□□ 2.743e-6■■■■■ 31.5
GEMIN5Q8TEQ6 FSCN1-205ENST00000473330 2215 ntTSL 227.16■■□□□ 1.942e-11■■■■■ 31.5
GEMIN5Q8TEQ6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.424e-6■■■■■ 31.5
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-215ENST00000439101 779 ntTSL 542.26■■■■■ 4.361e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-209ENST00000424537 781 ntTSL 241.8■■■■■ 4.281e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.111e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-219ENST00000452891 575 ntTSL 437.05■■■■□ 3.521e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-210ENST00000426941 575 ntTSL 237.05■■■■□ 3.521e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-207ENST00000420551 395 ntTSL 533.58■■■□□ 2.971e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-214ENST00000436917 499 ntTSL 433.35■■■□□ 2.931e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-227ENST00000483603 572 ntTSL 533.35■■■□□ 2.931e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-213ENST00000436402 600 ntTSL 533.11■■■□□ 2.891e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-217ENST00000442307 923 ntTSL 232.52■■■□□ 2.81e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.591e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.481e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.31e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-211ENST00000429279 580 ntTSL 428.96■■■□□ 2.231e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-232ENST00000495372 561 ntTSL 228.13■■■□□ 2.091e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.741e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-216ENST00000440109 935 ntTSL 323.5■■□□□ 1.351e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-220ENST00000461760 644 ntTSL 319.24■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK25-206ENST00000413760 801 ntTSL 316.17■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 PKP4-207ENST00000457109 520 ntTSL 314.3□□□□□ -0.125e-10■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.485e-10■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.845e-10■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.915e-10■■■■■ 31.4
GEMIN5Q8TEQ6 CDK4-208ENST00000551706 984 ntTSL 1 (best)27.48■■□□□ 1.992e-6■■■■■ 31.3
GEMIN5Q8TEQ6 CDK4-212ENST00000552388 694 ntTSL 320.8■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 31.3
GEMIN5Q8TEQ6 CDK4-214ENST00000552862 447 ntTSL 320.32■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 31.3
GEMIN5Q8TEQ6 TNPO3-203ENST00000471234 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 TNPO3-205ENST00000627585 4514 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.554e-6■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.684e-6■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.74e-6■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 CCT7-204ENST00000409924 567 ntTSL 332.16■■■□□ 2.744e-13■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 CCT7-211ENST00000480489 527 ntTSL 232.16■■■□□ 2.744e-13■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 CCT7-203ENST00000399032 593 ntTSL 431.08■■■□□ 2.574e-13■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 CCT7-206ENST00000464397 583 ntTSL 225.6■■□□□ 1.694e-13■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 CCT7-208ENST00000471927 556 ntTSL 425.02■■□□□ 1.64e-13■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 CCT7-209ENST00000473197 595 ntTSL 425.02■■□□□ 1.64e-13■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 CCT7-205ENST00000461290 1018 ntTSL 224.15■■□□□ 1.464e-13■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 CCT7-207ENST00000469844 612 ntTSL 421.84■■□□□ 1.094e-13■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 CCT7-214ENST00000492253 531 ntTSL 411.18□□□□□ -0.624e-13■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 INSIG1-205ENST00000468307 852 ntTSL 58.01□□□□□ -1.135e-18■■■■■ 31.2
GEMIN5Q8TEQ6 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 31.1
GEMIN5Q8TEQ6 BCL2L11-205ENST00000393252 482 ntTSL 243.93■■■■■ 4.626e-7■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 BCL2L11-211ENST00000433098 1197 ntTSL 543.53■■■■■ 4.566e-7■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.389e-9■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 GALNS-204ENST00000562831 609 ntTSL 340.48■■■■■ 4.079e-9■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 GLI4-208ENST00000522033 615 ntTSL 237.12■■■■□ 3.536e-7■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 KANSL1-214ENST00000576739 592 ntTSL 235.46■■■■□ 3.274e-6■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 GLI4-204ENST00000517530 563 ntTSL 235.14■■■■□ 3.226e-7■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.196e-7■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.166e-7■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.169e-9■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.129e-9■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 GLI4-209ENST00000522479 435 ntTSL 333.97■■■■□ 3.036e-7■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 GALNS-207ENST00000565364 1075 ntTSL 1 (best)33.57■■■□□ 2.969e-9■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 SEMA7A-204ENST00000567345 674 ntTSL 433.23■■■□□ 2.919e-9■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 ICAM5-202ENST00000586004 567 ntTSL 432.4■■■□□ 2.782e-6■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 ATF1-202ENST00000549612 568 ntTSL 532■■■□□ 2.719e-9■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 TBKBP1-203ENST00000578982 733 ntTSL 331.21■■■□□ 2.599e-9■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.566e-7■■■■■ 31
GEMIN5Q8TEQ6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.516e-7■■■■■ 31
Retrieved 100 of 19,123 protein–RNA pairs in 456.4 ms