RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522033.1

GLI4-208, Transcript of GLI family zinc finger 4, human

TSL 2

Gene GLI4, Length 615 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GLI4-208	ENST00000522033	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.32	■■■■■ 6.61
GLI4-208	ENST00000522033	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.21	■■■■■ 5.63
GLI4-208	ENST00000522033	ABCC9	O60706	1549 aa		49.43	■■■■■ 5.5
GLI4-208	ENST00000522033	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.46	■■■■■ 5.19
GLI4-208	ENST00000522033	NACAD	O15069	1562 aa		47.33	■■■■■ 5.17
GLI4-208	ENST00000522033	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.28	■■■■■ 5.16
GLI4-208	ENST00000522033	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.96	■■■■■ 5.11
GLI4-208	ENST00000522033	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.81	■■■■■ 5.08
GLI4-208	ENST00000522033	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.61	■■■■■ 5.05
GLI4-208	ENST00000522033	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.27	■■■■■ 5
GLI4-208	ENST00000522033	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.16	■■■■■ 4.98
GLI4-208	ENST00000522033	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		45.94	■■■■■ 4.94
GLI4-208	ENST00000522033	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.74	■■■■■ 4.91
GLI4-208	ENST00000522033	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		45.67	■■■■■ 4.9
GLI4-208	ENST00000522033	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.55	■■■■■ 4.88
GLI4-208	ENST00000522033	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.8	■■■■■ 4.76
GLI4-208	ENST00000522033	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.7	■■■■■ 4.75
GLI4-208	ENST00000522033	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.48	■■■■■ 4.71
GLI4-208	ENST00000522033	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.74	■■■■■ 4.59
GLI4-208	ENST00000522033	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.69	■■■■■ 4.58
GLI4-208	ENST00000522033	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.68	■■■■■ 4.58
GLI4-208	ENST00000522033	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.62	■■■■■ 4.57
GLI4-208	ENST00000522033	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.58	■■■■■ 4.57
GLI4-208	ENST00000522033	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.4	■■■■■ 4.54
GLI4-208	ENST00000522033	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.35	■■■■■ 4.53
GLI4-208	ENST00000522033	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.34	■■■■■ 4.53
GLI4-208	ENST00000522033	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.25	■■■■■ 4.51
GLI4-208	ENST00000522033	WIZ	O95785	1651 aa		42.86	■■■■■ 4.45
GLI4-208	ENST00000522033	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.77	■■■■■ 4.44
GLI4-208	ENST00000522033	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.69	■■■■■ 4.42
GLI4-208	ENST00000522033	NES	P48681	1621 aa		42.64	■■■■■ 4.42
GLI4-208	ENST00000522033	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.57	■■■■■ 4.41
GLI4-208	ENST00000522033	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.42	■■■■■ 4.38
GLI4-208	ENST00000522033	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.4	■■■■■ 4.38
GLI4-208	ENST00000522033	CUX2	O14529	1486 aa		42.37	■■■■■ 4.37
GLI4-208	ENST00000522033	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.35	■■■■■ 4.37
GLI4-208	ENST00000522033	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.12	■■■■■ 4.33
GLI4-208	ENST00000522033	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.06	■■■■■ 4.32
GLI4-208	ENST00000522033	CFTR	P13569	1480 aa		42.05	■■■■■ 4.32
GLI4-208	ENST00000522033	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.94	■■■■■ 4.3
GLI4-208	ENST00000522033	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.88	■■■■■ 4.29
GLI4-208	ENST00000522033	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.87	■■■■■ 4.29
GLI4-208	ENST00000522033	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.86	■■■■■ 4.29
GLI4-208	ENST00000522033	WDR62	O43379	1518 aa		41.71	■■■■■ 4.27
GLI4-208	ENST00000522033	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.66	■■■■■ 4.26
GLI4-208	ENST00000522033	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.49	■■■■■ 4.23
GLI4-208	ENST00000522033	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	41.48	■■■■■ 4.23
GLI4-208	ENST00000522033	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.44	■■■■■ 4.22
GLI4-208	ENST00000522033	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.24	■■■■■ 4.19
GLI4-208	ENST00000522033	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.15	■■■■■ 4.18
GLI4-208	ENST00000522033	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.08	■■■■■ 4.17
GLI4-208	ENST00000522033	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.02	■■■■■ 4.16
GLI4-208	ENST00000522033	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.79	■■■■■ 4.12
GLI4-208	ENST00000522033	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.77	■■■■■ 4.12
GLI4-208	ENST00000522033	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.71	■■■■■ 4.11
GLI4-208	ENST00000522033	CUX1	P39880	1505 aa		40.69	■■■■■ 4.1
GLI4-208	ENST00000522033	SOGA1	O94964	1423 aa		40.67	■■■■■ 4.1
GLI4-208	ENST00000522033	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.63	■■■■■ 4.09
GLI4-208	ENST00000522033	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.63	■■■■■ 4.09
GLI4-208	ENST00000522033	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
GLI4-208	ENST00000522033	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.59	■■■■■ 4.09
GLI4-208	ENST00000522033	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.56	■■■■■ 4.08
GLI4-208	ENST00000522033	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.45	■■■■■ 4.07
GLI4-208	ENST00000522033	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
GLI4-208	ENST00000522033	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.36	■■■■■ 4.05
GLI4-208	ENST00000522033	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.28	■■■■■ 4.04
GLI4-208	ENST00000522033	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.27	■■■■■ 4.04
GLI4-208	ENST00000522033	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.25	■■■■■ 4.03
GLI4-208	ENST00000522033	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.22	■■■■■ 4.03
GLI4-208	ENST00000522033	FBLN2	P98095	1184 aa		40.22	■■■■■ 4.03
GLI4-208	ENST00000522033	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.2	■■■■■ 4.03
GLI4-208	ENST00000522033	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.17	■■■■■ 4.02
GLI4-208	ENST00000522033	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.16	■■■■■ 4.02
GLI4-208	ENST00000522033	CHD1	O14646	1710 aa		40.16	■■■■■ 4.02
GLI4-208	ENST00000522033	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.15	■■■■■ 4.02
GLI4-208	ENST00000522033	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.08	■■■■■ 4.01
GLI4-208	ENST00000522033	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.07	■■■■■ 4.01
GLI4-208	ENST00000522033	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.04	■■■■■ 4
GLI4-208	ENST00000522033	SYNJ2	O15056	1496 aa		39.99	■■■■□ 3.99
GLI4-208	ENST00000522033	TRIM41	Q8WV44	630 aa		39.95	■■■■□ 3.99
GLI4-208	ENST00000522033	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		39.87	■■■■□ 3.97
GLI4-208	ENST00000522033	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		39.87	■■■■□ 3.97
GLI4-208	ENST00000522033	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		39.87	■■■■□ 3.97
GLI4-208	ENST00000522033	ARHGEF11	O15085	1522 aa		39.85	■■■■□ 3.97
GLI4-208	ENST00000522033	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.78	■■■■□ 3.96
GLI4-208	ENST00000522033	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.73	■■■■□ 3.95
GLI4-208	ENST00000522033	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.72	■■■■□ 3.95
GLI4-208	ENST00000522033	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.7	■■■■□ 3.95
GLI4-208	ENST00000522033	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.67	■■■■□ 3.94
GLI4-208	ENST00000522033	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.58	■■■■□ 3.93
GLI4-208	ENST00000522033	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		39.58	■■■■□ 3.93
GLI4-208	ENST00000522033	NUP160	Q12769	1436 aa		39.51	■■■■□ 3.92
GLI4-208	ENST00000522033	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.48	■■■■□ 3.91
GLI4-208	ENST00000522033	IGF1R	P08069	1367 aa		39.45	■■■■□ 3.91
GLI4-208	ENST00000522033	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.44	■■■■□ 3.9
GLI4-208	ENST00000522033	CUL7	Q14999	1698 aa		39.34	■■■■□ 3.89
GLI4-208	ENST00000522033	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		39.22	■■■■□ 3.87
GLI4-208	ENST00000522033	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.22	■■■■□ 3.87
GLI4-208	ENST00000522033	JPH4	Q96JJ6	628 aa		39.19	■■■■□ 3.86
GLI4-208	ENST00000522033	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.12	■■■■□ 3.85

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