Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC45.51■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.49■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC45.48■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC45.47■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC45.46■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC45.45■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
RB1CC1Q8TDY2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC45.43■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC45.41■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC45.4■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC45.4■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC45.38■■■■■ 4.86
RB1CC1Q8TDY2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC45.32■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC45.32■■■■■ 4.85
RB1CC1Q8TDY2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC45.3■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms