Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf43Q8TAL5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C9orf43Q8TAL5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C9orf43Q8TAL5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf43Q8TAL5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf43Q8TAL5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf43Q8TAL5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf43Q8TAL5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms