Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIPK4Q8NE63 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIPK4Q8NE63 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms