Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00269Q8N2A0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms