Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMNTD2Q8IXW0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms