Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APLFQ8IW19 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APLFQ8IW19 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms