Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D4Q7Z3S7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D4Q7Z3S7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms