Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PACS1Q6VY07 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS1Q6VY07 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms