Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf48Q6RUI8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C19orf48Q6RUI8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms