Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASC4Q6P4E1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC4Q6P4E1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms