Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3BQ5T9A4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATAD3BQ5T9A4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms