Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNT1Q5JUK3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNT1Q5JUK3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms