Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms