Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA6Q15825 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA6Q15825 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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