Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 52.2
EFTUD2Q15029 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-9■■■■■ 52.2
EFTUD2Q15029 NIFK-204ENST00000451734 559 ntTSL 316.41■□□□□ 0.221e-9■■■■■ 52.2
EFTUD2Q15029 NIFK-205ENST00000477693 1096 ntTSL 1 (best)9.55□□□□□ -0.881e-9■■■■■ 52.2
EFTUD2Q15029 MAPK8IP3-209ENST00000566064 511 ntTSL 217.4■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 52.2
EFTUD2Q15029 MAPK8IP3-208ENST00000564868 870 ntTSL 317.17■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 52.2
EFTUD2Q15029 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 52.1
EFTUD2Q15029 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 52.1
EFTUD2Q15029 SELENOH-203ENST00000533321 1454 ntTSL 1 (best)16.17■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 52.1
EFTUD2Q15029 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 52.1
EFTUD2Q15029 SELENOH-202ENST00000528798 469 ntTSL 214.84□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 52.1
EFTUD2Q15029 SELENOH-205ENST00000534386 1039 ntTSL 213.95□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 52.1
EFTUD2Q15029 KBTBD11-OT1-205ENST00000636175 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.88■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 KBTBD11-OT1-203ENST00000635773 5844 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.76□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 CHTF8-209ENST00000522497 831 ntTSL 222.39■■□□□ 1.174e-10■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 CHTF8-211ENST00000567763 734 ntTSL 221.97■■□□□ 1.114e-10■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.044e-10■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.934e-10■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.94e-10■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.534e-10■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 SEC31A-231ENST00000510310 584 ntTSL 424.36■■□□□ 1.492e-9■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 FHOD1-202ENST00000561922 2069 ntTSL 221.6■■□□□ 1.052e-9■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 SEC31A-221ENST00000507340 587 ntTSL 418.47■□□□□ 0.552e-9■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 SEC31A-223ENST00000507816 546 ntTSL 418.36■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 SEC31A-233ENST00000511975 564 ntTSL 416.35■□□□□ 0.212e-9■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 SEC31A-225ENST00000507867 682 ntTSL 316.35■□□□□ 0.212e-9■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 SEC31A-238ENST00000514326 847 ntTSL 314.97□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 SEC31A-206ENST00000436790 1717 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 HNRNPM-216ENST00000602219 1809 nt14.17□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 SEC31A-236ENST00000513323 822 ntTSL 312.32□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 SEC31A-219ENST00000506497 926 ntTSL 37.99□□□□□ -1.132e-9■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 SEC31A-210ENST00000503058 706 ntTSL 56.55□□□□□ -1.362e-9■■■■■ 52
EFTUD2Q15029 TRIP10-204ENST00000595319 776 ntTSL 522.16■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 51.9
EFTUD2Q15029 TRIP10-207ENST00000596673 586 ntTSL 313.4□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 51.9
EFTUD2Q15029 TRIP10-205ENST00000596078 1010 ntTSL 513.14□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 51.9
EFTUD2Q15029 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 318.2■□□□□ 0.55e-8■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.229e-9■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.029e-9■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.199e-9■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.269e-9■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.279e-9■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.279e-9■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.379e-9■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 KCNAB2-203ENST00000352527 4165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.459e-9■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 KCNAB2-204ENST00000378083 4142 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.459e-9■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.547e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.417e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 CDKN1C-205ENST00000471157 944 ntTSL 223.59■■□□□ 1.377e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.197e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.087e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)19.91■□□□□ 0.787e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.767e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.737e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.687e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.617e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 NT5DC2-215ENST00000492555 2004 ntTSL 1 (best)18.58■□□□□ 0.567e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 PTMS-206ENST00000540874 501 ntTSL 217.53■□□□□ 0.47e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.337e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.287e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 PLEKHG2-205ENST00000451354 871 ntTSL 516.21■□□□□ 0.197e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.127e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 NT5DC2-213ENST00000489316 772 ntTSL 515.13■□□□□ 0.017e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 GAPDH-210ENST00000496049 390 ntTSL 214.9□□□□□ -0.021e-19■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.147e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 PLEKHG2-201ENST00000205135 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.27e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 EDRF1-209ENST00000525091 4211 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.227e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.277e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.337e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.357e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 212.88□□□□□ -0.357e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 NT5DC2-212ENST00000487779 536 ntTSL 312.44□□□□□ -0.427e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.437e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 NT5DC2-208ENST00000471522 582 ntTSL 312.26□□□□□ -0.457e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 EDRF1-208ENST00000481600 4181 ntTSL 212.12□□□□□ -0.477e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 EDRF1-206ENST00000419769 4243 ntTSL 1 (best)11.9□□□□□ -0.57e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 EDRF1-202ENST00000356792 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.627e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 EDRF1-205ENST00000368815 4123 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.667e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 KIF23-204ENST00000558303 1766 ntTSL 29.29□□□□□ -0.927e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 NT5DC2-211ENST00000486792 419 ntTSL 38.89□□□□□ -0.997e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.117e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.197e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 TARS-206ENST00000504698 633 ntTSL 37.53□□□□□ -1.27e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 CRBN-210ENST00000491834 5628 ntTSL 1 (best)7.47□□□□□ -1.217e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 KIF23-212ENST00000560125 532 ntTSL 57.39□□□□□ -1.237e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.257e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 CRBN-209ENST00000488263 4528 ntTSL 1 (best)5.53□□□□□ -1.527e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 COPS3-209ENST00000486810 938 ntTSL 35.41□□□□□ -1.547e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 CRBN-202ENST00000424814 2038 ntTSL 54.33□□□□□ -1.727e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 COPS3-217ENST00000583160 365 ntTSL 53.3□□□□□ -1.887e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 CRBN-208ENST00000482844 653 ntTSL 43.18□□□□□ -1.97e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 COPS3-211ENST00000495640 333 ntTSL 32.81□□□□□ -1.967e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 CRBN-207ENST00000480249 565 ntTSL 42.78□□□□□ -1.967e-10■■■■■ 51.8
EFTUD2Q15029 P3H3-203ENST00000538102 710 ntTSL 313.11□□□□□ -0.319e-8■■■■■ 51.7
EFTUD2Q15029 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.272e-9■■■■■ 51.7
EFTUD2Q15029 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.732e-9■■■■■ 51.7
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