Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC1AQ14683 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC1AQ14683 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
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