Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX39BQ13838 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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