Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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