Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNB2Q03252 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMNB2Q03252 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNB2Q03252 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms