Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFKB2Q00653 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB2Q00653 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms