Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC5Q00444 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC5Q00444 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC5Q00444 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC5Q00444 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC5Q00444 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC5Q00444 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC5Q00444 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms