Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIM1P81133 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIM1P81133 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SIM1P81133 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIM1P81133 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIM1P81133 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIM1P81133 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIM1P81133 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIM1P81133 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIM1P81133 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIM1P81133 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIM1P81133 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIM1P81133 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIM1P81133 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIM1P81133 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIM1P81133 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIM1P81133 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIM1P81133 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIM1P81133 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIM1P81133 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIM1P81133 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIM1P81133 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIM1P81133 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIM1P81133 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIM1P81133 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIM1P81133 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIM1P81133 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIM1P81133 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIM1P81133 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIM1P81133 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIM1P81133 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIM1P81133 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIM1P81133 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIM1P81133 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIM1P81133 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIM1P81133 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIM1P81133 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIM1P81133 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIM1P81133 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIM1P81133 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIM1P81133 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIM1P81133 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIM1P81133 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIM1P81133 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIM1P81133 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIM1P81133 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIM1P81133 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIM1P81133 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIM1P81133 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIM1P81133 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SIM1P81133 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIM1P81133 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIM1P81133 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIM1P81133 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIM1P81133 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIM1P81133 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIM1P81133 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIM1P81133 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SIM1P81133 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIM1P81133 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIM1P81133 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIM1P81133 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIM1P81133 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIM1P81133 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIM1P81133 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIM1P81133 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIM1P81133 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SIM1P81133 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SIM1P81133 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIM1P81133 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIM1P81133 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIM1P81133 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIM1P81133 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIM1P81133 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIM1P81133 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIM1P81133 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIM1P81133 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SIM1P81133 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIM1P81133 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIM1P81133 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIM1P81133 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIM1P81133 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIM1P81133 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIM1P81133 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIM1P81133 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIM1P81133 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIM1P81133 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIM1P81133 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIM1P81133 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIM1P81133 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIM1P81133 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIM1P81133 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIM1P81133 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIM1P81133 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIM1P81133 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIM1P81133 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIM1P81133 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIM1P81133 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIM1P81133 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIM1P81133 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms