Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS2P61201 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS2P61201 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS2P61201 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS2P61201 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS2P61201 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS2P61201 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS2P61201 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS2P61201 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS2P61201 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS2P61201 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS2P61201 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS2P61201 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS2P61201 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS2P61201 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS2P61201 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS2P61201 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS2P61201 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS2P61201 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS2P61201 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS2P61201 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS2P61201 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPS2P61201 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPS2P61201 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPS2P61201 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPS2P61201 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS2P61201 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS2P61201 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS2P61201 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS2P61201 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS2P61201 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS2P61201 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS2P61201 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS2P61201 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS2P61201 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS2P61201 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS2P61201 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS2P61201 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS2P61201 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS2P61201 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS2P61201 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS2P61201 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS2P61201 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS2P61201 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS2P61201 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS2P61201 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS2P61201 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS2P61201 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS2P61201 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS2P61201 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS2P61201 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS2P61201 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS2P61201 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS2P61201 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS2P61201 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS2P61201 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS2P61201 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS2P61201 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS2P61201 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS2P61201 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS2P61201 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS2P61201 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS2P61201 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS2P61201 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS2P61201 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS2P61201 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS2P61201 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS2P61201 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS2P61201 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS2P61201 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS2P61201 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS2P61201 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS2P61201 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS2P61201 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS2P61201 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS2P61201 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS2P61201 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS2P61201 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS2P61201 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS2P61201 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPS2P61201 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPS2P61201 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPS2P61201 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPS2P61201 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPS2P61201 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS2P61201 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS2P61201 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS2P61201 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS2P61201 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS2P61201 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS2P61201 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS2P61201 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS2P61201 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS2P61201 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS2P61201 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS2P61201 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS2P61201 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS2P61201 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS2P61201 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS2P61201 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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