Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX10P56693 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX10P56693 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX10P56693 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX10P56693 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX10P56693 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX10P56693 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX10P56693 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX10P56693 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SOX10P56693 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOX10P56693 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOX10P56693 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SOX10P56693 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX10P56693 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX10P56693 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX10P56693 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX10P56693 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX10P56693 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX10P56693 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX10P56693 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX10P56693 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX10P56693 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX10P56693 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX10P56693 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX10P56693 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX10P56693 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX10P56693 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX10P56693 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX10P56693 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX10P56693 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX10P56693 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX10P56693 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX10P56693 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX10P56693 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX10P56693 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX10P56693 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX10P56693 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX10P56693 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX10P56693 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX10P56693 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX10P56693 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX10P56693 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX10P56693 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX10P56693 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX10P56693 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX10P56693 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX10P56693 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX10P56693 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX10P56693 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX10P56693 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX10P56693 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX10P56693 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX10P56693 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX10P56693 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX10P56693 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX10P56693 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX10P56693 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX10P56693 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX10P56693 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX10P56693 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX10P56693 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX10P56693 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX10P56693 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX10P56693 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX10P56693 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX10P56693 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX10P56693 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX10P56693 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX10P56693 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX10P56693 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX10P56693 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX10P56693 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX10P56693 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX10P56693 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX10P56693 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX10P56693 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX10P56693 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX10P56693 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX10P56693 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX10P56693 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX10P56693 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX10P56693 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX10P56693 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOX10P56693 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOX10P56693 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOX10P56693 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOX10P56693 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOX10P56693 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SOX10P56693 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX10P56693 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX10P56693 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX10P56693 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX10P56693 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX10P56693 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX10P56693 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX10P56693 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX10P56693 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX10P56693 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX10P56693 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX10P56693 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms