Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN1P54253 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms