Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGGTBP53611 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGGTBP53611 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGGTBP53611 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms