Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAP1GDS1P52306 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1GDS1P52306 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms