Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR3P49682 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR3P49682 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR3P49682 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR3P49682 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR3P49682 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR3P49682 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR3P49682 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR3P49682 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR3P49682 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR3P49682 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR3P49682 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CXCR3P49682 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR3P49682 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR3P49682 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms