Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA1P49639 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms