Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBMS1P29558 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBMS1P29558 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBMS1P29558 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms