Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VARSP26640 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARSP26640 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARSP26640 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARSP26640 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARSP26640 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARSP26640 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARSP26640 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARSP26640 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARSP26640 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARSP26640 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VARSP26640 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VARSP26640 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VARSP26640 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VARSP26640 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VARSP26640 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VARSP26640 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VARSP26640 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VARSP26640 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VARSP26640 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VARSP26640 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VARSP26640 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VARSP26640 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VARSP26640 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VARSP26640 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VARSP26640 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VARSP26640 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VARSP26640 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VARSP26640 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VARSP26640 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VARSP26640 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VARSP26640 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VARSP26640 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VARSP26640 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VARSP26640 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VARSP26640 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VARSP26640 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VARSP26640 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VARSP26640 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VARSP26640 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VARSP26640 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VARSP26640 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VARSP26640 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VARSP26640 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VARSP26640 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VARSP26640 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VARSP26640 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VARSP26640 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VARSP26640 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VARSP26640 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VARSP26640 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VARSP26640 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VARSP26640 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VARSP26640 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VARSP26640 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VARSP26640 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VARSP26640 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VARSP26640 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VARSP26640 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VARSP26640 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VARSP26640 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VARSP26640 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VARSP26640 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VARSP26640 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VARSP26640 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VARSP26640 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VARSP26640 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VARSP26640 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VARSP26640 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VARSP26640 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VARSP26640 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VARSP26640 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VARSP26640 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VARSP26640 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VARSP26640 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VARSP26640 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VARSP26640 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VARSP26640 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VARSP26640 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VARSP26640 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VARSP26640 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VARSP26640 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VARSP26640 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VARSP26640 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VARSP26640 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VARSP26640 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VARSP26640 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VARSP26640 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VARSP26640 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VARSP26640 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VARSP26640 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VARSP26640 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VARSP26640 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VARSP26640 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VARSP26640 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VARSP26640 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VARSP26640 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VARSP26640 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VARSP26640 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VARSP26640 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms