Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.875e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CTDSP1-213ENST00000496785 460 ntTSL 520.44■□□□□ 0.865e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-226ENST00000527418 4508 ntTSL 220.1■□□□□ 0.817e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.815e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CTDSP1-207ENST00000473420 922 ntTSL 320.01■□□□□ 0.795e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.785e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MRPL38-203ENST00000461602 880 ntTSL 319.83■□□□□ 0.775e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 USP39-209ENST00000458268 751 ntTSL 419.82■□□□□ 0.765e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 KMT5C-210ENST00000589338 1601 ntTSL 1 (best)19.82■□□□□ 0.765e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 KMT5C-211ENST00000592631 869 ntTSL 319.2■□□□□ 0.665e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.665e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.645e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 518.93■□□□□ 0.625e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.615e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PAM16-210ENST00000575636 732 ntTSL 318.86■□□□□ 0.615e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MRPL38-214ENST00000493383 727 ntTSL 218.82■□□□□ 0.65e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.565e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PAM16-205ENST00000571986 606 ntTSL 318.49■□□□□ 0.555e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.555e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CTDSP1-215ENST00000498160 877 ntTSL 518.47■□□□□ 0.555e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 AP3S1-204ENST00000506430 718 ntTSL 518.46■□□□□ 0.555e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CTDSP1-203ENST00000431127 586 ntTSL 318.45■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 USP39-208ENST00000455732 623 ntTSL 318.44■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TRIM41-203ENST00000503114 1904 ntTSL 1 (best)18.42■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MRPL38-209ENST00000477736 843 ntTSL 218.35■□□□□ 0.535e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.475e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MRPL38-206ENST00000474548 529 ntTSL 217.95■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SLC27A5-205ENST00000595851 2003 ntTSL 217.94■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.467e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 USP39-211ENST00000465282 568 ntTSL 417.91■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-221ENST00000552383 1267 ntTSL 217.91■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MRPL38-215ENST00000494179 870 ntTSL 317.76■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 317.71■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.415e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 AP3S1-208ENST00000515066 1670 ntTSL 217.41■□□□□ 0.385e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 KMT5C-203ENST00000445196 2077 ntTSL 517.33■□□□□ 0.375e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.355e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.345e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SPPL2B-203ENST00000586332 496 ntTSL 317.16■□□□□ 0.345e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CORO7-PAM16-201ENST00000572274 672 ntTSL 517.13■□□□□ 0.335e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.335e-11■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TNRC18-206ENST00000434361 577 ntTSL 317.1■□□□□ 0.334e-11■■■■■ 34.8
DDX6P26196 KMT5C-206ENST00000468951 661 ntTSL 317.1■□□□□ 0.335e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 KMT5C-204ENST00000460956 637 ntTSL 517.03■□□□□ 0.325e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 KMT5C-205ENST00000464185 2235 ntTSL 1 (best)17.02■□□□□ 0.325e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.315e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 AC087289.3-201ENST00000590947 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.99■□□□□ 0.315e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CTDSP1-209ENST00000488627 1118 ntTSL 316.95■□□□□ 0.35e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CTDSP1-214ENST00000497677 998 ntTSL 216.95■□□□□ 0.35e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 DNAJB6-208ENST00000441561 1022 ntTSL 516.93■□□□□ 0.35e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.295e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.295e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 USP39-205ENST00000442708 561 ntTSL 416.86■□□□□ 0.295e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.285e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.274e-11■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CTDSP1-202ENST00000428361 842 ntTSL 516.65■□□□□ 0.265e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CTDSP1-205ENST00000452977 818 ntTSL 516.65■□□□□ 0.265e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CORO7-PAM16-203ENST00000575334 3815 ntTSL 216.51■□□□□ 0.235e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PAM16-206ENST00000573236 704 ntTSL 1 (best)16.49■□□□□ 0.235e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.235e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.25e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PISD-206ENST00000431201 460 ntTSL 416.26■□□□□ 0.195e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PISD-205ENST00000429683 609 ntTSL 316.26■□□□□ 0.195e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PAM16-203ENST00000571819 317 ntTSL 516.24■□□□□ 0.195e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PAM16-209ENST00000573614 650 ntTSL 516.23■□□□□ 0.195e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MKNK2-207ENST00000588014 2413 ntTSL 216.21■□□□□ 0.195e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.185e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 USP39-217ENST00000491659 648 ntTSL 316.11■□□□□ 0.175e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TRIM41-207ENST00000515223 5707 ntTSL 215.83■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.15e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PAM16-202ENST00000571178 353 ntTSL 315.51■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 USP39-206ENST00000448971 610 ntTSL 315.42■□□□□ 0.065e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.055e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.055e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.035e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.035e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.015e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.017e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.037e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 GTF3C1-211ENST00000569653 897 ntTSL 214.8□□□□□ -0.045e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CTDSP1-210ENST00000491064 786 ntTSL 314.77□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SLC8B1-214ENST00000552565 2287 ntTSL 214.76□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 ADAM15-216ENST00000472434 2894 ntTSL 514.69□□□□□ -0.067e-8■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 GTF3C1-205ENST00000564747 2798 nt14.63□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 34.8
DDX6P26196 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.085e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 RAVER1-204ENST00000592208 4693 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.085e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 CTDSP1-212ENST00000494067 362 ntTSL 314.38□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 34.8
DDX6P26196 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.125e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 TGIF1-209ENST00000546979 554 ntTSL 314.27□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 34.8
DDX6P26196 DNAJB6-214ENST00000486083 699 ntTSL 514.18□□□□□ -0.145e-6■■■■■ 34.8
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