Protein–RNA interactions for Protein: P25025

CXCR2, C-X-C chemokine receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR2P25025 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR2P25025 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR2P25025 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms