Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNE1P24864 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNE1P24864 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms