Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASTP20810 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASTP20810 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASTP20810 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASTP20810 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASTP20810 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASTP20810 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASTP20810 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASTP20810 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASTP20810 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASTP20810 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASTP20810 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASTP20810 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASTP20810 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASTP20810 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CASTP20810 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASTP20810 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASTP20810 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASTP20810 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASTP20810 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASTP20810 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASTP20810 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASTP20810 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CASTP20810 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CASTP20810 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASTP20810 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASTP20810 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASTP20810 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASTP20810 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASTP20810 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASTP20810 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASTP20810 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASTP20810 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASTP20810 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CASTP20810 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASTP20810 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASTP20810 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASTP20810 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASTP20810 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASTP20810 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASTP20810 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASTP20810 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASTP20810 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASTP20810 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CASTP20810 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASTP20810 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASTP20810 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASTP20810 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASTP20810 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CASTP20810 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASTP20810 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASTP20810 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASTP20810 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASTP20810 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASTP20810 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASTP20810 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASTP20810 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASTP20810 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASTP20810 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASTP20810 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASTP20810 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASTP20810 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASTP20810 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CASTP20810 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASTP20810 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASTP20810 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CASTP20810 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CASTP20810 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASTP20810 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASTP20810 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CASTP20810 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASTP20810 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASTP20810 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CASTP20810 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASTP20810 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CASTP20810 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASTP20810 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASTP20810 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASTP20810 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASTP20810 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASTP20810 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASTP20810 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CASTP20810 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASTP20810 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASTP20810 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASTP20810 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASTP20810 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASTP20810 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASTP20810 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASTP20810 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CASTP20810 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASTP20810 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASTP20810 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CASTP20810 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CASTP20810 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CASTP20810 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CASTP20810 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CASTP20810 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CASTP20810 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CASTP20810 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms