Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2B1P20020 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2B1P20020 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B1P20020 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms