Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT15P19012 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT15P19012 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT15P19012 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT15P19012 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT15P19012 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT15P19012 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT15P19012 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT15P19012 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT15P19012 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT15P19012 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT15P19012 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT15P19012 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT15P19012 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT15P19012 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT15P19012 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT15P19012 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT15P19012 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT15P19012 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT15P19012 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT15P19012 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT15P19012 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT15P19012 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT15P19012 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT15P19012 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT15P19012 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT15P19012 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT15P19012 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT15P19012 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT15P19012 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT15P19012 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT15P19012 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT15P19012 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT15P19012 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT15P19012 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT15P19012 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT15P19012 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT15P19012 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT15P19012 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT15P19012 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT15P19012 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT15P19012 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT15P19012 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT15P19012 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT15P19012 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT15P19012 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT15P19012 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT15P19012 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT15P19012 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT15P19012 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT15P19012 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT15P19012 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT15P19012 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT15P19012 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT15P19012 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT15P19012 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT15P19012 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT15P19012 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT15P19012 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT15P19012 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT15P19012 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT15P19012 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT15P19012 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT15P19012 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT15P19012 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT15P19012 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT15P19012 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT15P19012 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT15P19012 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT15P19012 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT15P19012 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT15P19012 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT15P19012 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT15P19012 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT15P19012 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT15P19012 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT15P19012 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT15P19012 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT15P19012 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT15P19012 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT15P19012 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT15P19012 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT15P19012 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT15P19012 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT15P19012 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT15P19012 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms