Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT10P13645 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT10P13645 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT10P13645 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT10P13645 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT10P13645 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT10P13645 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT10P13645 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT10P13645 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT10P13645 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT10P13645 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT10P13645 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT10P13645 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT10P13645 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT10P13645 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT10P13645 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT10P13645 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT10P13645 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT10P13645 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT10P13645 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT10P13645 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT10P13645 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT10P13645 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT10P13645 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT10P13645 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT10P13645 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT10P13645 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT10P13645 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT10P13645 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT10P13645 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT10P13645 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT10P13645 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT10P13645 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT10P13645 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT10P13645 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT10P13645 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT10P13645 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT10P13645 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT10P13645 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT10P13645 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT10P13645 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT10P13645 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT10P13645 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT10P13645 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT10P13645 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT10P13645 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT10P13645 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT10P13645 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT10P13645 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT10P13645 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT10P13645 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT10P13645 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT10P13645 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT10P13645 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT10P13645 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT10P13645 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT10P13645 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT10P13645 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT10P13645 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT10P13645 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT10P13645 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT10P13645 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT10P13645 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT10P13645 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT10P13645 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT10P13645 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT10P13645 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT10P13645 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT10P13645 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT10P13645 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT10P13645 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT10P13645 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT10P13645 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT10P13645 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT10P13645 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT10P13645 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT10P13645 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT10P13645 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT10P13645 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT10P13645 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT10P13645 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT10P13645 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT10P13645 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT10P13645 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT10P13645 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT10P13645 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT10P13645 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT10P13645 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT10P13645 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT10P13645 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT10P13645 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT10P13645 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT10P13645 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT10P13645 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT10P13645 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT10P13645 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT10P13645 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT10P13645 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT10P13645 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT10P13645 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms