Protein–RNA interactions for Protein: P07949

RET, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETP07949 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETP07949 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETP07949 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETP07949 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETP07949 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETP07949 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETP07949 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETP07949 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETP07949 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETP07949 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETP07949 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETP07949 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RETP07949 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETP07949 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETP07949 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETP07949 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETP07949 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETP07949 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETP07949 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETP07949 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETP07949 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETP07949 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETP07949 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETP07949 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETP07949 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETP07949 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETP07949 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETP07949 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETP07949 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETP07949 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETP07949 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETP07949 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RETP07949 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETP07949 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETP07949 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETP07949 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETP07949 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETP07949 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETP07949 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETP07949 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETP07949 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETP07949 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETP07949 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETP07949 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETP07949 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RETP07949 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RETP07949 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETP07949 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETP07949 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RETP07949 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RETP07949 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETP07949 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETP07949 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETP07949 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETP07949 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETP07949 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETP07949 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETP07949 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETP07949 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETP07949 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETP07949 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETP07949 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETP07949 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETP07949 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETP07949 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RETP07949 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETP07949 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETP07949 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETP07949 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETP07949 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETP07949 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETP07949 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETP07949 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETP07949 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETP07949 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETP07949 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RETP07949 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RETP07949 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETP07949 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RETP07949 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RETP07949 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETP07949 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETP07949 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RETP07949 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RETP07949 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETP07949 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETP07949 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETP07949 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RETP07949 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETP07949 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETP07949 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETP07949 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETP07949 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETP07949 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETP07949 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETP07949 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RETP07949 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RETP07949 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RETP07949 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RETP07949 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms