Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLBP06746 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLBP06746 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLBP06746 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLBP06746 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLBP06746 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLBP06746 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLBP06746 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLBP06746 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLBP06746 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLBP06746 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLBP06746 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLBP06746 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLBP06746 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLBP06746 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLBP06746 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLBP06746 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLBP06746 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLBP06746 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLBP06746 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLBP06746 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLBP06746 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLBP06746 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLBP06746 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLBP06746 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLBP06746 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLBP06746 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLBP06746 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLBP06746 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLBP06746 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLBP06746 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLBP06746 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLBP06746 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLBP06746 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLBP06746 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLBP06746 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLBP06746 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLBP06746 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLBP06746 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLBP06746 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLBP06746 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLBP06746 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLBP06746 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLBP06746 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLBP06746 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLBP06746 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLBP06746 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLBP06746 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLBP06746 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLBP06746 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLBP06746 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLBP06746 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLBP06746 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLBP06746 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLBP06746 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLBP06746 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLBP06746 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLBP06746 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLBP06746 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLBP06746 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLBP06746 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLBP06746 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLBP06746 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLBP06746 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLBP06746 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLBP06746 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLBP06746 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLBP06746 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLBP06746 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLBP06746 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLBP06746 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLBP06746 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLBP06746 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLBP06746 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLBP06746 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLBP06746 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLBP06746 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLBP06746 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLBP06746 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLBP06746 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLBP06746 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLBP06746 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLBP06746 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLBP06746 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms