Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC3P02656 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC3P02656 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC3P02656 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC3P02656 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC3P02656 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC3P02656 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC3P02656 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC3P02656 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC3P02656 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC3P02656 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC3P02656 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC3P02656 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC3P02656 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC3P02656 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC3P02656 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC3P02656 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC3P02656 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC3P02656 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC3P02656 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC3P02656 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC3P02656 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC3P02656 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC3P02656 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC3P02656 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC3P02656 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC3P02656 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC3P02656 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC3P02656 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC3P02656 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOC3P02656 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC3P02656 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC3P02656 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC3P02656 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC3P02656 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC3P02656 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC3P02656 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC3P02656 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC3P02656 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC3P02656 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC3P02656 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC3P02656 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC3P02656 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC3P02656 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC3P02656 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC3P02656 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC3P02656 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC3P02656 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC3P02656 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC3P02656 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC3P02656 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC3P02656 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC3P02656 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC3P02656 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC3P02656 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC3P02656 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC3P02656 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC3P02656 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC3P02656 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC3P02656 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC3P02656 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC3P02656 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC3P02656 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC3P02656 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC3P02656 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC3P02656 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC3P02656 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC3P02656 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC3P02656 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC3P02656 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC3P02656 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC3P02656 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC3P02656 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC3P02656 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC3P02656 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC3P02656 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC3P02656 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC3P02656 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC3P02656 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC3P02656 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC3P02656 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC3P02656 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC3P02656 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC3P02656 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC3P02656 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC3P02656 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC3P02656 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC3P02656 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC3P02656 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC3P02656 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC3P02656 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC3P02656 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC3P02656 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC3P02656 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
APOC3P02656 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
APOC3P02656 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC3P02656 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC3P02656 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC3P02656 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC3P02656 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms