Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHEK2O96017 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHEK2O96017 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHEK2O96017 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms