Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOMM40O96008 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOMM40O96008 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms