Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRIG2O94898 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRIG2O94898 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms