Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 TANGO6-204ENST00000561931 585 ntTSL 312.83□□□□□ -0.363e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC35B1-206ENST00000504260 2424 ntTSL 212.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC22A18AS-201ENST00000455942 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.363e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MYO1C-217ENST00000575011 385 ntTSL 312.77□□□□□ -0.373e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.383e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TRIP12-210ENST00000453485 652 ntTSL 312.68□□□□□ -0.383e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PINX1-205ENST00000523559 778 ntTSL 312.67□□□□□ -0.383e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CCDC85C-205ENST00000556348 556 ntTSL 512.66□□□□□ -0.383e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MYO18A-210ENST00000531267 334 ntTSL 212.6□□□□□ -0.393e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AC005537.1-204ENST00000609382 813 ntTSL 512.57□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AC005537.1-203ENST00000629291 1748 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 HIST1H2BG-201ENST00000541790 1534 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MAP3K14-AS1-207ENST00000588698 460 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PINX1-204ENST00000520018 601 ntTSL 512.52□□□□□ -0.413e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PLP2-202ENST00000376327 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.413e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ALOX12-AS1-203ENST00000570562 567 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.413e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CTSH-208ENST00000529263 770 ntTSL 512.45□□□□□ -0.423e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NEK9-210ENST00000557026 5177 ntTSL 212.39□□□□□ -0.433e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ATP2A1-203ENST00000536376 3130 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.443e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MYO1C-210ENST00000572615 1035 ntTSL 312.31□□□□□ -0.443e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CSNK1G1-203ENST00000606225 1950 ntTSL 1 (best)12.29□□□□□ -0.445e-8■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PRDM2-204ENST00000376048 2688 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.453e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 L3MBTL3-207ENST00000529410 4518 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.453e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PINX1-203ENST00000519088 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.453e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 IGSF3-202ENST00000369483 7326 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.463e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 IGSF3-203ENST00000369486 7254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.473e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF571-AS1-205ENST00000588382 543 ntTSL 412.1□□□□□ -0.473e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.483e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CD99-209ENST00000497752 806 ntTSL 212.06□□□□□ -0.483e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LARS2-204ENST00000430399 566 ntTSL 412.06□□□□□ -0.482e-17■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MN1-202ENST00000424656 620 ntTSL 512.01□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LYRM1-207ENST00000567165 931 ntTSL 1 (best)11.99□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF540-210ENST00000592533 3147 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CELF5-203ENST00000541430 4268 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.53e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 FAXDC2-209ENST00000520461 603 ntTSL 411.95□□□□□ -0.53e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PGAP3-209ENST00000584620 804 ntTSL 311.93□□□□□ -0.53e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 PINX1-206ENST00000524026 571 ntTSL 411.91□□□□□ -0.53e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ATP2A1-202ENST00000395503 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.523e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC7A7-202ENST00000397528 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.523e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC7A7-203ENST00000397529 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.523e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SH3BGR-204ENST00000380637 1014 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.523e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ROBO2-212ENST00000602589 3382 ntTSL 511.76□□□□□ -0.533e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NTRK1-204ENST00000489021 570 ntTSL 411.74□□□□□ -0.533e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC12A4-215ENST00000575857 588 ntTSL 311.71□□□□□ -0.533e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 NUBPL-202ENST00000418681 1804 ntTSL 211.68□□□□□ -0.545e-8■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PABPC1L-209ENST00000465761 801 ntTSL 211.6□□□□□ -0.553e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LYRM1-210ENST00000568820 1695 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SWI5-203ENST00000418976 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 CTSH-217ENST00000534533 836 ntTSL 311.41□□□□□ -0.583e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC35B1-210ENST00000508520 845 ntTSL 511.4□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AL132780.3-201ENST00000555074 835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.593e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 LIN37-208ENST00000592871 561 ntTSL 411.25□□□□□ -0.613e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 L3MBTL3-204ENST00000526019 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.613e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CCDC85C-203ENST00000554996 619 ntTSL 411.22□□□□□ -0.613e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LIN37-201ENST00000301159 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.613e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CNTNAP1-204ENST00000591662 4499 ntTSL 1 (best)11.14□□□□□ -0.633e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 C12orf66-202ENST00000398055 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.643e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NFYC-212ENST00000440226 1717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.643e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CLSTN3-203ENST00000534830 547 ntTSL 411.05□□□□□ -0.643e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TTC28-AS1-214ENST00000435348 578 ntTSL 411.04□□□□□ -0.643e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PPP1R3E-202ENST00000558058 3222 ntTSL 310.96□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 INTS9-211ENST00000521022 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.663e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 USP39-210ENST00000459775 2148 ntTSL 210.89□□□□□ -0.673e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC25A11-203ENST00000570543 322 ntTSL 510.84□□□□□ -0.673e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AC005537.1-205ENST00000630282 883 ntTSL 510.75□□□□□ -0.693e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.693e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 INTS9-217ENST00000523303 2578 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.693e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 KDM2B-212ENST00000541318 600 ntTSL 410.71□□□□□ -0.693e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NFYC-207ENST00000414185 677 ntTSL 310.69□□□□□ -0.73e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.73e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NCEH1-204ENST00000475381 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.733e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF571-AS1-201ENST00000585578 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.743e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NFYC-203ENST00000372652 2363 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.743e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LIG3-216ENST00000593099 4664 ntTSL 210.36□□□□□ -0.753e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MRPS18B-209ENST00000492316 512 ntTSL 210.35□□□□□ -0.753e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 FAM193B-218ENST00000515394 589 ntTSL 210.35□□□□□ -0.753e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NFYC-201ENST00000308733 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AL356235.1-201ENST00000602791 2363 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.773e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CTSH-205ENST00000528191 569 ntTSL 410.22□□□□□ -0.773e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 USP39-214ENST00000474572 293 ntTSL 410.22□□□□□ -0.773e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PINX1-208ENST00000524114 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 310.2□□□□□ -0.783e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TANGO6-201ENST00000261778 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.783e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ST6GALNAC4-204ENST00000474282 384 ntTSL 310.17□□□□□ -0.783e-9■■■■■ 206.8
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